Am Lehrstuhl für Pflanzenökologie gibt es aktuell zwei Arbeitsgruppen. Die AG Molekulare Ökologie und Naturschutzgenetik (Prof. Dr. Christoph Reisch) forscht zu Themen wie Vegetationsökologie, Landschaftsgenetik, Naturschutzgenetik und Ökologische Epigenetik. Die AG Pflanzenökologie (N.N.) hat sich bisher schwerpunktmäßig mit Themen aus den Bereichen Populationsbiologie der Pflanzen und Samenökologie befasst. Prof. Dr. Peter Poschlod befindet sich jedoch seit 2024 im Ruhestand.
