Am 1. Juli 2016 haben das Universitätsklinikum Regensburg (UKR) und das Caritas-Krankenhaus St. Josef das Comprehensive Cancer Center Ostbayern (CCCO) ins Leben gerufen. Das CCCO trägt dazu bei, Krebsmedizin im ostbayrischen Raum nach höchsten medizinischen Standards zu etablieren und neue Diagnose- und Therapieverfahren zu entwickeln.

Die Gemeinsame Wissenschaftskonferenz hat am 1. Juli 2022 die Errichtung des Exzellenzgebäudes CITO in die gemeinsame Förderung von Forschungsbauten mit einem Förderbeginn ab 2023 aufgenommen.

Das José-Carreras-Centrum für Somatische Zelltherapie (JCC) ist ein spezialisiertes Laborzentrum, das 2008 / 2009 am Universitätsklinikum Regensburg errichtet wurde. Das Laborzentrum bietet alle technischen Möglichkeiten zur Entwicklung und Herstellung moderner Zellmedikamente und wird als regionales Kompetenzzentrum auch Wissenschaftlern anderer Universitätsklinika in Bayern, z.B. innerhalb des Bayerischen Immuntherapie-Netzwerkes (BayImmuNet), zur Verfügung stehen.

des Fraunhofer Institutes für Toxikologie und Experimentelle Medizin ITEM 
Bereichsleiter: Prof. Dr. Christoph Klein, Fraunhofer Institut

Das Regensburger Centrum für Interventionelle Immunologie (RCI) als zentrale Einrichtung der Universität Regensburg und als Partner des Universitätsklinikums (Freistaat Bayern) wurde zum 1. Januar 2022 als außeruniversitäres Leibniz-Institut für Immuntherapie (LIT) etabliert.

Das RCBE ist eine fakultäts- und hochschulübergreifende Forschungseinrichtung der Ostbayerischen Technischen Hochschule Regensburg (OTH Regensburg) und der Universität Regensburg bzw. der Fakultät für Medizin.

Im RCBE werden biomedizinische Kompetenz und ingenieur-wissenschaftliche sowie medizininformatische Kompetenz gebündelt. Die Schwerpunkte des RCBE im Hinblick auf Forschung sind Medizinische Informatik und  Biomedical Engineering, die  sich in den jeweiligen Kooperationsstudiengängen widerspiegeln.

Das Regensburg Center of Neuroscience (RCN) fördert gezielt die fakultätsübergreifende Vernetzung der Forschungs- und Lehr-Aktivitäten zwischen experimentellen und klinischen Neurowissenschaften an der Universität Regensburg.

Bereits seit 2008 werden zur Behandlung von Patienten mit Hirntumoren Kooperationen mit strahlentherapeutischen Kliniken in Bayern als Sattelitenzentren durchgeführt. Diese werden im Zentrum für Hirntumoren koordiniert. Hierdurch werden heimatnahe Studienbehandlungen in Kooperation mit den Satellitenzentren möglich.