Konrad Baumgartner wurde im Jahr 1940 in Altötting geboren und besuchte von 1950 bis 1954 das Gymnasium in Burghausen sowie anschließend in Passau, wo er im Jahr 1959 das Abitur ablegte. Es folgte ein Studium der Philosophie und Theologie an der Philosophisch-Theologischen Hochschule Passau von 1959 bis 1965.
Konrad Baumgartner legte die Theologische Prüfung am 25. Juli 1964 ab und empfing am 29. Juni 1965 in Passau die Priesterweihe durch Bischof Simon Konrad Landersdorfer. Im Rahmen seiner pastoralen Tätigkeit wirkte er als Kaplan in Spiegelau / Bayerischer Wald (1965/1966) sowie als Seminarpräfekt im Seminar St. Valentin in Passau (1966-1968) und arbeitete in der Pfarrgemeinde St. Lantpert/München (1968-1976), im Seelsorger-Team der Pfarrei Egweil/Attenfeld im Bistum Eichstätt (ab 1977) und später in Oppersdorf/Hainsacker im Bistum Regensburg.
Den zweiten Studienabschnitt absolvierte er von 1968 bis 1975 an der Ludwig-Maximilians-Universität München, wo er am 19. Dezember 1974 zum Thema „Die Seelsorge im Bistum Passau zwischen barocker Tradition, Aufklärung und Restauration“ promovierte.
In den Jahren 1969 bis 1971 war Konrad Baumgartner zunächst als wissenschaftliche Hilfskraft und von September 1971 bis August 1976 als wissenschaftlicher Assistent am Lehrstuhl für Religionspädagogik der Universität München tätig. Zum 1. September 1976 wurde er auf die Professur für Pastoraltheologie am Fachbereich Katholische Theologie der Kirchlichen Gesamthochschule Eichstätt berufen.
Zum 1. September 1980 übernahm Prof. Dr. Baumgartner den Lehrstuhl für Praktische Theologie (Pastoraltheologie) an der Universität Regensburg. Hier widmete er sich der Geschichte der Pastoraltheologie (vor allem Johann Michael Sailer), der Theologie und Pastoral der Sakramente, der Gesprächs- und Einzelseelsorge, der Gemeindepastoral sowie der Pastoral von Kranken, Sterbenden und Trauernden. Im Jahr 2001 verlieh ihm Bischof Manfred Müller den Titel eines Päpstlichen Ehrenprälaten. Von 2003 bis 2005 war er Dekan der Fakultät für Katholische Theologie. Zum 1. April 2006 trat er in den Ruhestand.
Die Universität Regensburg wird Professor Dr. Konrad Baumgartner stets ein ehrendes Gedenken bewahren.
